Calcolo della meccanica quantistica computazionale: 4 passaggi

2024 Autore: John Day | [email protected]. Ultima modifica: 2024-01-30 10:01

I calcoli computazionali in chimica e fisica possono rivelare proprietà molto interessanti su alcuni campioni (soprattutto se sono soggetti a modifiche per una migliore efficienza di un dato composto originale). nelle procedure, oltre a fattori di momento di dipolo, instabilità, mappa del potenziale elettrostatico, diagramma di energia e calcoli di reattività propabilistica, dove l'uso di calcoli quantistici computazionali accorcia il tempo di laboratorio, rendendo chiaro e specifico se la sintesi di un possibile composto è praticabile. economicamente e temporalmente dicendo.

Forniture

• quantistica
• Modellazione molecolare.
• Orbitali molecolari Orca Avogadro

Fase 1: Calcolo della meccanica quantistica computazionale - Avogadro

Come primo passo, scarica Avogadro che ha la possibilità di input con il software Orca

Nel software Avogadro, hai la garanzia di creare le tue molecole e ottimizzarle del 99,9%; per evitare conflitti con il comando Ctrl + Alt + o, che a sua volta non garantisce un'adeguata compressione molecolare quando si utilizzano le estensioni di input per Orca.

Per ottimizzare la molecola creare prima la molecola di interesse (ovviamente), poi cliccare sulla E (notare che sotto questa E c'è una freccia in basso), così apparirà un calcolo simile nell'angolo in alto a sinistra della schermata contenente il software.

Passaggio 2: il software Orca

Con questo input eseguito correttamente, fai clic sulla scheda delle estensioni, sempre facendo riferimento al software Avogadro, e cerca l'opzione ORCA

Clicca su Avanzate, quando si apre la schermata per la creazione dell'input, e su Data segna l'opzione MO e la seconda sotto. - LASCIARE DUE SEGNI - per ottenere densità elettronica e orbitali molecolari attivati durante i calcoli quantistici che Orca eseguirà - solo procedure di input;)

Dopo tale procedura nella scheda Base, completare dopo il comando:! RHF SP def2-SVP

inserisci il codice correttamente/con attenzione…

! Stampa normale

% produzione

Stampa [P_Base] 2

Stampa [P_MOs] 1

fine

DETTAGLIO, prima di eseguire tale operazione scarica e installa Orca sul tuo computer!

Dopo aver eseguito i comandi precedenti, fai clic su Crea e salva tale file. Inp nella cartella in cui è installato Orca. (Esempio: ho installato Orca sull'unità C del mio computer -> salva il file nell'unità C del tuo computer all'interno della cartella Orca).

Passaggio 3: in Cmd Esegui…

Apri cmd e digita:

cd C:\Orca; Il software Orca è installato sull'unità C del tuo computer … e premi invio.

Otterrai una schermata simile all'immagine di questa parte, dopo tale procedura, nota se il comando è corretto tramite lo script C: / Orca>Se questo comando è corretto, digita davanti al segno più (>) il comando:

orca.exe (il nome della molecola che hai salvato nella cartella Orca).inp > (il nome della molecola che hai salvato nella cartella Orca).out

DETTAGLIO - NON CI SONO PARENTI NEL COMANDO E SOLO IL NOME DELLA TUA MOLECOLA

Dopodiché premi invio e attendi … Nel mio caso ho perso il comando più volte perché la molteplicità coinvolta è un valore dispari e anche il mio numero di elettroni è dispari, se ciò accade cambia il valore della molteplicità a 2 nel passaggio precedente in Basic (in software Avogadro).

Passaggio 4: aspetta un minuto…

Dopo aver dato il comando, cerca una sottolineatura sulla riga di comando successiva di cmd

se c'è, WONDER, continuando… Attendi qualche istante finché non appare il termine di script:

cd: / Orca_

Per assicurarti che il tuo file.out sia stato generato all'interno della cartella di installazione di Orca, quella in cui è stato salvato il file di input creato in Avogadro.

Dopo che il calcolo è stato eseguito tramite cmd in Orca, cerca il file.out nella cartella Orca. A questo punto puoi chiudere la tua molecola (Avogadro) e cmd, alla fine il calcolo quantistico è già stato fatto …

Nel passaggio successivo, apri nuovamente Avogadro e nella scheda Apri, cerca il file.out generato e aprilo; vedrai che ci sarà la tua molecola accanto ai valori HOMO e LUMO Orbital, trascina leggermente la scheda verso il basso e vedrai che ci sono calcoli per gli orbitali che daranno circa il 100% di ottimizzazione, come rivela l'immagine.

…e divertiti…